2017. február. 21.


Frissítve: 2017 január 25 szerda, 09:45:32.

NeuroProteomikai és Lipidomikai Laboratórium



1994-ben alakítottuk ki az Intézet Analitikai Laboratóriumát, melynek feladata kezdettől fogva aminosavak, peptidek és fehérjék elválasztástechnikán és tömegspektrometrián alapuló analízise volt. Ebből a háttérből nőtt ki 2004-ben a NeuroProteomikai Laboratórium, melynek fő tudományos érdeklődési területe a pszichiátriai és neurodegenerációs betegségek fehérjeszintű molekuláris hátterének vizsgálata. Saját kutatási területünkön végzett munkákon túl számtalan proteomikai fehérjeazonosítást végeztünk legkülönbözőbb eredetű mintákból, így Streptomyces Griseus baktériumból, C. Elegans gyűrűsféregből, növényekből (lucerna, búza, tritikálé) egér, patkány, liba, juh, marha és humán szövetekből, ill. sejttenyészetekből.

A laboratórium műszerparkja fokozatosan fejlődött, s mára rendelkezünk az expressiós proteomika magas szintű műveléséhez szükséges felszereltséggel, ill. humán erőforrással. Fehérjék nagyhatékonyságú elválasztását 1D-, ill. 2D-PAGE elektroforézissel (BioRad, Hoefer), ill. folyadékkromatográfiával (Agilent, Waters) végezzük. Differenciál-expressziós vizsgálatokhoz képesek vagyunk nagyméretű géleket futtatni, ill. azokat fluoreszcens scanneren (FujiFilm FLA 5100) a Progenesis SameSpot szoftverrel kiértékelni. A Waters QTOF Premier tömegspekrométerünk lehetővé teszi fehérjék nagy sorozatban történő, nagy pontosságú és érzékenységű meghatározását. A Finnigan TSQ-7000 típusú hármas-kvadrupól készülékünkön rutin tömegspektrometriás vizsgálatokat végzünk.  A mérési eredmények bioinformatikai kiértékelését két adatbáziskereső (MASCOT, PLGS), egy összegző, analizáló (Scaffold) és egy biológiai értelmező (Pathway Studio) tudjuk elvégezni.

A biológiai rendszerek működésének jobb megismerése érdekében kutatási területünket néhány évvel ezelőtt kiegészítettük a lipidomika módszereivel. Foszfolipidek biológiai folyadékokból és szövetekből történt extrakciója után az egy és kétdimenziós HPLC elválasztást követő tömegspektrometriás detektálással nyert adatokat speciális lipidomikai-metabolomikai szoftverrel (Waters Progenesis QI) tudjuk kiértékelni.


Munkatársak:

Prof. Dr. Janáky Tamás, a laboratórium vezetője

Dr. Kele Zoltán

Dr. Szabó Zoltán

Dr. Berkecz Róbert

Dr. Ábrahámné Szendrei Rita



Szolgáltatások:

  1. Aminosavanalízis ( származékképzés, HPLC)
  2. Peptidek kvalitatív és kvantitatív HPLC analízise
  3. Komplex fehérjeminták analízise 1D- és 2D gélelektroforézissel
  4. Farmakokinetikai vizsgálatok biológiai folyadékokból, szövetekből HPLC-MS módszerrel
  5. Szintetikus, ill. izolált vegyületek molekulatömegének/tisztaságának vizsgálata tömegspektrometriás és/vagy LC-MS módszerekkel
  6. Peptidek és fehérjék előkészítése tömegspektrometriás vizsgálatokhoz (enzimatikus/kémiai reakciók kivitelezése)
  7. Fehérjék azonosításá oldató v. gélekből enzimatikus/kémiai reakciókat követően LC-MS/MS módszerekkel
  8. Fehérje-expresszió összehasonlító vizsgálata 2D gélelektroforézissel, ill. LC-MS módszerekkel
  9. Foszfolipidek extrakciója és kvalitatív és kvantitatív analízise biológiai folyadékokból, szövetekből


Kapcsolódó információk:


Mintaelőkészítésről

Fehérjeazonosítási kérőlap

Az SKI igénybevételi szabályai

Árlista

OviJobb09.jpg

Webkamera

domter_webcam